SCIEX和Illumina共同研發（fā）整合咗

SCIEX和Illumina 共（gòng）同研發整合蛋白質組學和（hé）基因組學

近，美（měi）國的三個研發機構發布了分（fèn）析和比較蛋白質組學和基（jī）因組（zǔ）學數據的新應用，這些應用方法（fǎ）是OneOmics項目的一部分。OneOmics是Illumina和SCIEX的合作項目。

為了消除不同組學之間的信息壁壘，OneOmics項目將（jiāng）SCIEX基於新一代（dài）蛋白質組學 的SWATH 采（cǎi）集係統和（hé）Illumina公司基於BaseSpace雲計算的新（xīn）一代測序數據相結合。Advaita Bioinformatics注：小抗拉強度值不是鏈條的工作（zuò）載荷公司、係統生物學研究所和耶魯大學的研究人員也在采用（yòng）SWATH蛋白質組學數據開發雲技術對與國內實驗機（jī）廠家來講的應用程序和數據庫。

係統生物學研究所副（fù）教授Rob Moritz帶領團隊開發（fā）了SWATHAtlas Ion Library Gen"飛機減重能夠節省燃料本錢erator應用程序，它提供了快捷進（jìn）入ISB數據庫（kù）的方法，為具有SWATH采集係統的NGP服務。目前，ISB數據庫已經包括了人、酵母和結核杆菌蛋白質組數據庫。我（wǒ）們很高興成（chéng）為SCIEX和（hé）Illumina合作項（xiàng）目的一部分， Moritz說，ISB和整個學術界（jiè）開發的這些應用程（chéng）序提供了一個強大的解決（jué）方案，這不僅給蛋白質組學研究道路帶來很大影響，而且將會建成係統生物學數據係統。

Advaita公司為BaseSpace平（píng）台（tái）研（yán）發了iPathwayGuide分析包。該（gāi）應用分析包可以（yǐ）用作生化（huà）途徑分析、GO分析、miRNA預測、藥物和疾病分析。它簡化了從整（zhěng）合蛋白質組學、轉錄組學數據庫尋找生物數據的過程，並將有助於推進生物標誌物的發現和疾病（bìng）研究。

耶魯大學的Chris Colangelo和Rob Kitchen共同為BaseSpace平台開發了RNASeq應用程序。這個應（yīng）用程（chéng）序能將一（yī）個Illumina的RNASeq實驗數據轉換為一（yī）種（zhǒng）蛋白質數（shù）據組，得到的數據可以為建立SCIEX SWATHTM采（cǎi）集係統數據庫。因此，它是一個更有針對性的蛋白質組學分析方法，這對某特殊疾病的遺傳（chuán）學研究者來說非常有用。這一（yī）係列工作流程（chéng）是（shì）係統生物學研究的普通需求，但（dàn）直到現在隻有少數專（zhuān）業的實驗室能滿（mǎn）足這些複雜的生物信息學條款。

SWATHTM采集係統使研究人員能夠準確、多次的（de）從成（chéng）百的樣品中（zhōng）定量數以千計（jì）的蛋白質，從而得到在不同（tóng）環境刺激下蛋白質（zhì）組的變化等非常有（yǒu）意義的（de）結論。 SCIEX公司（sī）的理論（lùn）與臨床研究業務總監 Aaron Hudson說，下一步是將得到的（de）這些（xiē）蛋白質組（zǔ）學的結論與基因組（zǔ）學和轉錄組學（xué）等其他組學的結論整合在一起。此項目的三家合作（zuò）機構ISB、耶魯（lǔ）大學（xué）和Advaita Bioinformatics公司都推出了免費的應用程序，這（zhè）些應用程序對此工作方法的深入實驗室很有（yǒu）幫助，同時（shí）也鋪設了通向橫（héng）跨生命科學中兩大領域的標準化數據分析（xī）的道路。

編譯：郭浩楠